Dragon Drive énumère les aventures de l'étudiant Reiji Ozora qui perd par habitude espoir en tout ce qu'il commence et a des résultats scolaires catastrophiques. Fatigué de voir son ami abandonner tout ce qu'il entreprend, Maiko Yukino son ami d'enfance, montre à Reiji un jeu de réalité virtuelle appelé "Dragon Drive". C'est un jeu de combat dans lequel les joueurs et leurs dragons s'affrontent dans une ville virtuelle. Reiji, dont la personnalité est paresseuse, obtiendra en commençant le jeu un petit dragon, également paresseux, qu'il appelle Chibisuke. Néanmoins les deux protagonistes montreront à travers de nombreux combats que leur pouvoir ne correspond ni à leur taille ni à leur niveau de paresse et feront trembler plus d'un adversaire. Reiji et Chibi se retrouvent ensuite projeter dans un montre parallèle à la Terre, Ri-kyuu. On leur annonce qu'ils doivent participer à un tournoi afin de protéger les deux monde de Rion, un être qui veut gouverner la Terre et Ri-kyu en contrôlant les dragons.