Après une longue absence, Kamui Shirô revient à Tokyo, ville dans laquelle il a vécu étant enfant. Kamui doit récupérer une épée divine que possède le père de Kotori et Fûma (deux bons amies d’enfance). Mais c’est là que les choses se compliquent, deux groupes (les Dragons du Ciel et les Dragons de la Terre) demande à Kamui de les rejoindre. De son choix, découlera l’avenir du monde.