Au cours de l'ère Meiji, la guerre fait rage entre la Russie et le Japon, les deux puissances sont enlisées dans un conflit au cours duquel aucun des protagonistes ne semble pouvoir prendre l'ascendant sur l'autre.

Shintaro Umakai est un jeune professeur revenu au Japon après avoir travaillé quelques années à l'ambassade de son pays en Russie. On lui a confié à son retour un poste d'enseignant dans une académie pour jeunes filles située dans une région relativement isolée. A son arrivée, il découvre avec surprise que cette école est en réalité un cuirassier de la marine japonaise, et que les cinq demoiselles à qui il doit donner des cours sont en réalité les membres d'un projet top secret visant à développer une nouvelle arme qui pourrait faire basculer le en faveur du Japon si elle s'avère opérationnelle. En effet, chacune des ces jeune filles peut invoquer un Raimu, sorte de robot/esprit relié à son âme, au potentiel de destruction relativement important.

D'abord pris de court par cette découverte, Shintaro n'aura que peu de temps pour s'adapter à sa nouvelle situation, et se retrouvera finalement instructeur militaire de ce groupe pas comme les autres. Saura-t-il mener ses élèves jusqu'à la victoire?