L'Alice Academy est une école prestigieuse, mais aussi à la discipline stricte, dans laquelle les étudiants apprennent à maîtriser des dons innés comme la télékinésie, la voyance,... nommés "Alice". En tentant de retrouver son amie Hotaru, Mikan y sera intégrée par la force des choses, car il semblerait qu'elle renferme un Alice extrêmement rare… En le découvrant, elle fera d'étonnantes rencontres parmi ses nouveaux camarades tous plus uniques les uns que les autres.