Matthew Macfadyen est né dans le Norfolk, en Angleterre, le 17 octobre 1974.
De 1985 à 1992, il a été élève de l'Oakham School dans le comté de Rutland, où il a fait des études de théâtre.
En 1992, à l'âge de 17 ans, il est admis à la prestigieuse Royal Academy of Dramatic Art à Londres, dont il sort diplômé en juillet 1995 et dont il est membre associé.
Matthew Macfadyen entame sa carrière au théâtre, en rejoignant la troupe Cheek by Jowl (en) avec laquelle il effectue plusieurs tournées internationales...