Ayatsuji Yukito, de son vrai nom Uchida Naoyuki, est né en 1960 à Kyoto. Pendant ses études à l'université de Kyoto, il fait partie du club des amateurs de romans policiers où il rencontre sa future femme, Ono Fuyumi, qui deviendra elle-même auteur avec notamment la série Les douze royaumes. En 1987, Meurtres dans le Décagone marque ses débuts d'écrivain et constitue le premier volume de sa série de romans policiers Meurtres dans la maison... Ayatsuji Yukito remporte en 1992 le grand prix du roman policier japonais avec Meurtres dans la maison aux horloges.

Il est connu pour avoir lancé le style "néo-classique" du roman policier japonais qui renoue avec les enquêtes de détectives et les intrigues de logique pure. Il a également signé des scénarios de manga et de séries pour la télévision