Episode 1 : L'enchanteur désenchanté
Après dix années passées à assurer l'éducation du prince Arthur, Merlin considère avoir accompli sa mission. Il se retire dans la forêt de Brocéliande afin de mener une existence paisible au milieu des animaux. Mais l'arrivée de l'excentrique fée Viviane va bouleverser sa vie. Elle souhaite qu'il éduque son fils Lancelot. D'abord récalcitrant, Merlin cède finalement sous la pression de Viviane qui ne le laisse pas indifférent. Au même moment, le mariage entre Arthur et la princesse Guenièvre vient perturber le calme qui règne sur le royaume en provoquant la colère de Morgane, la cousine d'Arthur, amoureuse de lui depuis son plus jeune âge...
Episode 2 : Le secret de Brocéliande
Merlin a perdu tous ses pouvoirs, en se sacrifiant par amour. Il forme avec Viviane un couple heureux même si, avec le temps, la fée se montre de plus en plus envahissante. Las de vivre sans magie, il se plaint auprès de Kantor, son mentor, qui lui laisse entrevoir une solution. Pendant ce temps, Morgane et son allié, le cruel Vortigern, parviennent à s'extraire de la prison de boue dans laquelle Viviane et Merlin les avaient enfermés depuis 7 ans. La sorcière n'a plus qu'un seul et unique but: se venger et écarter la reine Guenièvre du trône pour prendre sa place auprès d'Arthur. Merlin ne le sait pas encore mais pour sauver Viviane et le royaume, il va bientôt devoir partir à la recherche du Graal...