Au Japon, durant la période Edo, Zatoïchi est un masseur aveugle itinérant. Il est cependant extrêmement doué au sabre, particulièrement en iaidō.

Ayant fréquenté les yakuzas, il se retrouve régulièrement entraîné dans des querelles. Il essaye cependant de protéger les innocents de ces luttes entre clans.