Ce film commence en 1999 dans un San Francisco en ruines. Un jeune homme, Wataru, est poursuivi par un mecha après avoir été témoin d'un massacre commis par ce dernier. Il est sauvé de justesse par Sophia, une femme aux cheveux blancs, qui lui dit comment détruire le "Guardian". Wataru est surpris par le fait qu'elle sache parler mieux que lui. En effet, depuis que cette apocalypse qui s'est abattue sur la Terre, les Hommes ne savent plus parler.
Qu'est-ce que l'Homme sans ses mémoires ? Qu'est-ce que l'Homme sans la science, sans la parole, sans rien sauf ses instincts ? C'est ce que vont essayer de découvrir Wataru et Sophia pendant leur pénible à travers les États-Unis frappés d'amnésie générale.